น้ำมันตับปลาค็อดและน้ำมันปลา มีกรดไขมันโอเมก้า 3 สูง ซึ่งเป็นประโยชน์ต่อร่างกายของคนเราและช่วยป้องกันโรคบางอย่างได้ น้ำมันทั้งสองชนิดมีแหล่งที่มาแตกต่างกัน น้ำมันตับปลาค็อดสกัดจากปลาค็อดแปซิฟิกและแอตแลนติกในขณะที่น้ำมันปลามานั้นจากเนื้อเยื่อของปลา เช่น ปลาแมคเคอเรล ปลาเฮอริ่ งปลาทูน่า และปลาแซลมอน
หากต้องการรับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารน้ำมันตับปลาค็อดและน้ำมันปลา ควรเลือกรับประทานเพียงอย่างใดอย่างหนึ่งเท่านั้น เพราะอาจทำให้บริโภคกรดไขมันโอเมก้า 3 มากเกินไปจนอาจทำให้เกิดผลข้างเคียง การรับประทานน้ำมันตับปลาค็อดถือว่าไม่เป็นอันตราย แต่อาจทําให้เกิดผลข้างเคียง เช่น แสบร้อนกลางหน้าอก ท้องอืด เลือดกําเดาไหล และเลือดแข็งตัวได้ช้า
สำหรับสตรีมีครรภ์ไม่ควรรับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารน้ำมันตับปลาค็อด เนื่องจากมีวิตามิน เอ ในระดับสูงที่อาจเป็นอันตรายต่อทารกในครรภ์ ก่อนรับประทานผลิตภัณฑ์เสริมอาหารใด ๆ ควรปรึกษาแพทย์โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่เป็นโรคหัวใจหรือแพ้อาหารทะเล เช่น ปลาและสัตว์เปลือกแข็ง